| Cluster ID | Skin | Oral | Gut | Vaginal |
|---|---|---|---|---|
| C1 | Yes | No | Yes | Yes |
| C9 | Yes | No | No | Yes |
| C12 | Yes | No | No | Yes |
| C24 | Yes | No | No | Yes |
| C27 | Yes | No | No | Yes |
| C28 | Yes | No | No | Yes |
| C31 | No | Yes | No | Yes |
| C182 | No | No | No | Yes |
| C702 | No | No | No | Yes |
| C703 | No | No | No | Yes |
| C948 | No | No | No | Yes |
| C1123 | No | No | No | Yes |
| C1404 | No | No | No | Yes |
| C1557 | No | No | No | Yes |
| C1638 | No | No | No | Yes |
| C1664 | No | No | No | Yes |
| C1665 | No | No | No | Yes |
| C1666 | No | No | No | Yes |
| C1810 | No | No | No | Yes |
| C1811 | No | No | No | Yes |
| C1813 | No | No | No | Yes |
| C2104 | No | No | No | Yes |
| C2520 | No | No | No | Yes |
| C3096 | No | No | No | Yes |
| C3151 | No | No | No | Yes |
| C3152 | No | No | No | Yes |
| C3203 | No | No | No | Yes |
| C3219 | No | No | No | Yes |
| C3220 | No | No | No | Yes |
| C3398 | No | No | No | Yes |
| C3399 | No | No | No | Yes |
| C3400 | No | No | No | Yes |
| C3401 | No | No | No | Yes |
| C3402 | No | No | No | Yes |
| C3403 | No | No | No | Yes |
| C3404 | No | No | No | Yes |
| C3405 | No | No | No | Yes |
| C3406 | No | No | No | Yes |
| C3407 | No | No | No | Yes |
| C3408 | No | No | No | Yes |
| C3409 | No | No | No | Yes |